Po ukończeniu Liceum Lotniczego w Dęblinie studiował w Wyższej Oficerskiej Szkole Lotniczej. W 1985 roku po promocji oficerskiej przydzielony został do 66 Lotniczego pułku szkolnego w Tomaszowie Mazowieckim na stanowisko instruktora-pilota, gdzie szkolił przyszłych adeptów lotnictwa wojskowego. W marcu 1989 roku dzięki znakomitemu wyszkoleniu osobistemu, po nagłym wyłączeniu się silnika samolotu TS-11 Iskra przy skrajnie niekorzystnych warunkach (za mała wysokość i prędkość) udało mu się bezpiecznie katapultować ratując życie. Zostało to docenione przez przełożonych,
a wnioski z tego zdarzenia zostały wdrożone do instrukcji bezpieczeństwa lotniczego.
Od 2001 do 2004 roku dowodził eskadrą lotniczą w 2 Ośrodku Szkolenia Lotniczego w Radomiu. Tam, będąc jeszcze w stopniu majora, swoim profesjonalnym działaniem w sytuacji krytycznej, uratował życie podchorążej pilot Joanny Erbetowskiej. Swoim spokojnym głosem i precyzyjnymi komendami uspokoił pilotkę w sytuacji awarii silnika samolotu PZL-130 Orlik, która na jego polecenie katapultowała się, ratując swoje życie jako pierwsza kobieta w polskim lotnictwie i pierwszy pilot na tym typie samolotu. Warto przypomnieć, że we wcześniejszych 3 katastrofach Orlików życie straciło 5 pilotów. W uznaniu zasług mjr Piłat został awansowany do stopnia podpułkownika.
W 2004 r. został skierowany na studia stacjonarne podyplomowe w Ogólnowojskowym Kolegium Ecole Militaire w Paryżu. Po powrocie do kraju został wyznaczony na dowódcę 12 Bazy Lotniczej w Mirosławcu. Zginął śmiercią lotnika
23 stycznia 2008 roku w katastrofie lotniczej samolotu CASA C-295M pod Mirosławcem. Został pochowany na cmentarzu Powązki Wojskowe w Warszawie.
Z dniem 30 września 2019 roku generał Jerzy Piłat został patronem 12. Bazy Bezzałogowych Statków Powietrznych w Mirosławcu, a dnia 6 października przyznano mu również tytuł Honorowego Obywatela Świdnika.
W 1996 r. Jerzy Piłat został wybrany głosami czytelników „Skrzydlatej Polski” - czasopisma o tematyce lotniczej wydawanej od 1930 roku - „Najsympatyczniejszym Instruktorem Samolotowym Lotnictwa Wojskowego”. Od tego momentu rozpoczęła się Jego przyjaźń z Podkarpaciem, śp. Panią Redaktor Bogusławą Nykiel-Ostrowską, która była inicjatorką wielu imprez związanych z lotnictwem, w których uczestniczył Pan Generał z Rodziną, m.in. Górskich Zawodów Balonowych. Od roku 2010 podczas Górskich Zawodów Balonowych w Krośnie jednocześnie odbywa się Memoriał im gen. bryg. pil. Jerzego Piłata.
